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Inicio

El Laboratorio de Investigación Traslacional y Biología Computacional comenzo sus actividades desde marzo del 2017.

Presentación

El Laboratorio de Investigación Traslacional y Biología Computacional se especializa en la integración y análisis de datos ómicos, aplicados al estudio de la biología del cáncer (adulto y pediátrico). Utilizamos herramientas computacionales y algoritmos de Machine Learning para el minado e interpretación de big data. También realizamos bioensayos y reposicionamiento de fármacos orientados al descubrimiento de nuevos agentes anti-parasitarios. 

Equipo de Investigación

PhD. MSc. Claudia Machicado Rivero, Jefe (Ver Ficha)

 Colaboradores

Dr. Luis A. Marcos Raymundo (Ver Ficha)

Dr. Timothy Thomson (CSIC, España)

Dr. Ygal Haupt (Peter MacCallum Cancer Centre, Australia).

Estudiantes:

        André Guerrero, Medicina

        Fresia Casas, Medicina

        María Teresa Castromonte, Biología

        Livisú Pajares, Biología

        Jesús Durand, Biología

        Juan José Contreras, Bioquímica

        Liani Bustamante, Biología

        Marco Acosta, Biología

        Fabrizio Oliveri, Biología y Química

        Pedro Huerta, Farmacia y Bioquímica

        Luis Felipe La Chira, Biología

Pasantes:

Vanessa Antón, UNMSM
María Pía Soto, Univ. Católica de Sta. María (Arequipa)

Proyectos en marcha

  • Factores de riesgo de la Covid-19.
  • Identificación in silico de candidatos antivirales contra SARS-Cov 2 de origen natural proveniente de plantas oriundas del Perú.
  • Genes supresores de tumor en cáncer de origen viral.
  • Genes reparadores del DNA en animales longevos y resistentes al cáncer (aproximación ómica a la Paradoja de Peto).
  • Metabolismo de glutamina en cáncer de origen viral.
  • Proteínas para uso en biorremediación
  • Metiloma, obesidad y cáncer cervical.
  • Metabolómica diferencial en cáncer colorrectal por género.
  • Integración de ómicas aplicada a cáncer pediátrico y regulación del sistema nervioso.
  • Proteínas nucleares en agentes infecciosos carcinogénicos
  • Kinasas y reposicionamiento de fármacos

Publicaciones

Revistas indexadas

  • Bandilovska Y, Keam S, Haup S, Machicado C, Haupt Y. E6AP goes viral: the role of E6AP in viral and non-viral related cancers. Carcinogenesis. 2019 Apr 10. pii: bgz072. doi: 10.1093/carcin/bgz072.
  • Machicado C, Soto MP, Timoteo O, Vaisberg A, Pajuelo M, Ortiz P, Marcos LA. Screening The Pathogen Box for Identification of New Chemicals Agents With Anti Fasciola hepatica Activity. Antimicrob Agents Chemother. 2019 Jan 2. pii: AAC.02373-18..
  • Machicado C, Bertani S, Herrera-Velit P, Espinoza JR, Ruiz E, Marcos LA. Screening of Fasciola hepatica in Peruvian patients with hepatocellular carcinoma (HCC). Rev. Soc. Bras. Med. Trop. 2018. 51(2): 231-6.
  • Machicado C., Marcos LA. A Computational Assessment of the Biological Features of the Human Macrophage-Migration Inhibitory Factor-1 Ortholog in Parasites and its Affinity to Human CD74 Receptor. Journal of Molecular Recognition. doi: 10.1002/jmr.2640.
  • Torres-Roman JS, Azañedo D, Avilez JL, Ruiz EF, Malaga G, Machicado C. Human papillomavirus-associated oropharyngeal cancer: prioritizing preventive policies in susceptible populations. Oral Oncol. 2017 Jun;69:129-130.
  • Machicado C., Terashima A., Maco V., Machicado J., Marcos LA. The relationship between Fascioliasis and liver cancer, fibrosis and cirrhosis: A Systematic Review. PLoS Negl Trop Dis. 2016 Sep 28;10(9):e0004962.
  • Machicado C., Marcos LA., Zimic M. Hypothetical Granulin-Like Molecule from Fasciola hepatica Recognized by Bioinformatics Analysis. SpringerPlus. 2016;5(1), 1-9.
  • Machicado C. & Marcos LA. Carcinogenesis associated with parasites other than Schistosoma, Opisthorchis and Clonorchis: A Systematic Review. Int. J Cancer. 2016. doi: 10.1002/ijc.30028.
  • Machicado C and Marcos LA. Identification of tumors in liver infected by Fasciola gigantica. Peruv J Parasitol. 2013;21(2):76-77
  • Thomson TM, Casas F, Guerrero HA, Figueroa-Mujíca R, Villafuerte FC, Machicado C. Potential Protective Effect from COVID-19 Conferred by Altitude: A Longitudinal Analysis in Peru During Full Lockdown. High Alt Med Biol. 2021 Mar 29. doi: 10.1089/ham.2020.0202. Epub ahead of print. PMID: 33780636.

Ponencias en congresos

  • Machicado C., Castromonte MT, Sancho C. Genomic features of Helicobacter pylori-associated gastric cancer and its enriched pathways. Proceedings of the 110th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, Atlanta. Accepted for publication (2019).
  • Machicado C. and Soto MP. Computational study of the effects of non-synonymous mutations in human UBE3A gene present in virus-associated cancers. Proceedings of the 109th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 1322A. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2018-1322A.
  • Machicado C. Computational analysis of mutations on neural signaling factor existing childhood cancer. Proceedings of the 108th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2017 Apr 01-05; Washington DC: AACR. Cancer Research 77(13 Supplement):3583-3583. Abstract nr 3585. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2017-3583.
  • Machicado C and Machicado E. Biomedical informatics applied to the analysis of colon cancer genome: looking for a mutational pattern associated to infectious-origin cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR. Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 1516. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2016-1516.
  • Machicado C and Marcos LA. A Bioinformatics Approach to Assess Parasite Kinases as Drug Targets using Anti Cancer Drugs. Proceedings of the 65th Annual Meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 2016 Nov 13-17; Atlanta, Georgia. ASTMH,95(5):318.
  • Oscanoa RM, Machicado C. Association of excess of body weight with promoter methylation in cervical cancer patients determined by a bioinformatics analysis. RECOMB Mayo 2020.

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