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Inicio

El Laboratorio de Investigación Traslacional y Biología Computacional comenzo sus actividades desde marzo del 2017.

Presentación

El Laboratorio de Investigación Traslacional y Biología Computacional se especializa en la integración y análisis de datos ómicos, provenientes de estudios genómicos, transcriptómicos, epigenómicos, metabolómicos, entre otros. Estudiamos la biología del cáncer, analizando Big data ómica, dando respuesta a preguntas de ciencia básica y encaminando nuestras investigaciones al descubrimiento marcadores moleculares. Utilizamos herramientas computacionales y algoritmos de Machine Learning para el minado e interpretación de Big data. Nuestros estudios de ómicas se complementan con estrategias de visualización 3D y modelamiento molecular, para comprender íntegramente al cáncer. También realizamos bioensayos y reposicionamiento de fármacos orientados al descubrimiento de nuevos agentes anticancerígenos y antiparasitarios

Equipo de Investigación

PhD. MSc. Claudia Machicado Rivero, Jefe (Ver Ficha)

 Colaboradores

Dr. Luis A. Marcos Raymundo (Ver Ficha)

Dr. Timothy Thomson (CSIC, España)

Dr. Ygal Haupt (Peter MacCallum Cancer Centre, Australia).

Estudiantes:

        Valeria Morales, Nutrición

         Miluska Mori, Nutrición

        Alessia Piamonte, Biología

        Livisú Pajares, Biología

        Jesús Durand, Biología

        Juan José Contreras, Bioquímica

        Liani Bustamante, Biología

        Marco Acosta, Biología

        Vilma Vise, Biología

        Pedro Huerta, Farmacia y Bioquímica

        Luis Felipe La Chira, Biología

        Alonso Quispe, Biología

        Rodrigo de Paz, Farmacia y Bioquímica

        Carmen Raraz, Farmacia y Bioquímica

Proyectos en marcha

  • Identificación in silico de candidatos antivirales contra SARS-Cov 2 de origen natural proveniente de plantas oriundas del Perú.
  • Metabolismo de glutamina en cáncer de origen viral.
  • Proteínas para uso en biorremediación
  • Integración de ómicas para la disección biológica del cáncer.
  • Proteínas nucleares en agentes infecciosos carcinogénicos.
  • Kinasas y reposicionamiento de fármacos.
  • Reconocimiento molecular en receptores olfativos.
  • Susceptibilidad de contagio por SARS-Cov-2 en mamíferos acuáticos.
  • Variantes genéticas de adaptación a altura.
  • Epigenética de la obesidad y el cáncer
  • Enzimas y microorganismos que degradan plásticos
  • Bioactivos de la microbiota y de mamíferos contra el cáncer
  • Resistencia al cáncer en mamíferos
  • Glutaminasa como diana terapéutica del cáncer.

Publicaciones

Revistas indexadas

  • Machicado, C., Soto, M. P., La Chira, L. F., Torres, J., Mendoza, C., & Marcos, L. A. (2021). In silico prediction of secretory proteins of Opisthorchis viverrini, Clonorchis sinensis and Fasciola hepatica that target the host cell nucleus. Heliyon7(7), e07204. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2021.e07204.
  • Thomson, T. M., Casas, F., Guerrero, H. A., Figueroa-Mujíca, R., Villafuerte, F. C., & Machicado, C. (2021). Potential Protective Effect from COVID-19 Conferred by Altitude: A Longitudinal Analysis in Peru During Full Lockdown. High altitude medicine & biology22(2), 209–224. https://doi.org/10.1089/ham.2020.0202
  • Bandilovska Y, Keam S, Haup S, Machicado C, Haupt Y. E6AP goes viral: the role of E6AP in viral and non-viral related cancers. Carcinogenesis. 2019 Apr 10. pii: bgz072. doi: 10.1093/carcin/bgz072.
  • Machicado C, Soto MP, Timoteo O, Vaisberg A, Pajuelo M, Ortiz P, Marcos LA. Screening The Pathogen Box for Identification of New Chemicals Agents With Anti Fasciola hepatica Activity. Antimicrob Agents Chemother. 2019 Jan 2. pii: AAC.02373-18..
  • Machicado C, Bertani S, Herrera-Velit P, Espinoza JR, Ruiz E, Marcos LA. Screening of Fasciola hepatica in Peruvian patients with hepatocellular carcinoma (HCC). Rev. Soc. Bras. Med. Trop. 2018. 51(2): 231-6.
  • Machicado, C., & Marcos, L. A. (2017). A computational assessment of the predicted structures of Human Macrophage Migration Inhibitory Factor 1 orthologs in parasites and its affinity to human CD74 receptor. Journal of molecular recognition : JMR30(10), 10.1002/jmr.2640. https://doi.org/10.1002/jmr.2640.
  • Torres-Roman JS, Azañedo D, Avilez JL, Ruiz EF, Malaga G, Machicado C. Human papillomavirus-associated oropharyngeal cancer: prioritizing preventive policies in susceptible populations. Oral Oncol. 2017 Jun;69:129-130.
  • Machicado C., Terashima A., Maco V., Machicado J., Marcos LA. The relationship between Fascioliasis and liver cancer, fibrosis and cirrhosis: A Systematic Review. PLoS Negl Trop Dis. 2016 Sep 28;10(9):e0004962.
  • Machicado C., Marcos LA., Zimic M. Hypothetical Granulin-Like Molecule from Fasciola hepatica Recognized by Bioinformatics Analysis. SpringerPlus. 2016;5(1), 1-9.
  • Machicado C. & Marcos LA. Carcinogenesis associated with parasites other than Schistosoma, Opisthorchis and Clonorchis: A Systematic Review. Int. J Cancer. 2016. doi: 10.1002/ijc.30028.
  • Machicado C and Marcos LA. Identification of tumors in liver infected by Fasciola gigantica. Peruv J Parasitol. 2013;21(2):76-77

Ponencias en congresos

  • Machicado C., Castromonte MT, Sancho C. Genomic features of Helicobacter pylori-associated gastric cancer and its enriched pathways. Proceedings of the 110th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, Atlanta. Accepted for publication (2019).
  • Machicado C. and Soto MP. Computational study of the effects of non-synonymous mutations in human UBE3A gene present in virus-associated cancers. Proceedings of the 109th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 1322A. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2018-1322A.
  • Machicado C. Computational analysis of mutations on neural signaling factor existing childhood cancer. Proceedings of the 108th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2017 Apr 01-05; Washington DC: AACR. Cancer Research 77(13 Supplement):3583-3583. Abstract nr 3585. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2017-3583.
  • Machicado C and Machicado E. Biomedical informatics applied to the analysis of colon cancer genome: looking for a mutational pattern associated to infectious-origin cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR. Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 1516. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2016-1516.
  • Machicado C and Marcos LA. A Bioinformatics Approach to Assess Parasite Kinases as Drug Targets using Anti Cancer Drugs. Proceedings of the 65th Annual Meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 2016 Nov 13-17; Atlanta, Georgia. ASTMH,95(5):318.
  • Oscanoa RM, Machicado C. Association of excess of body weight with promoter methylation in cervical cancer patients determined by a bioinformatics analysis. RECOMB Mayo 2020.

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Ubicación: Laboratorios de Investigación y Desarrollo
Piso - N°Laboratorio: Cuarto Piso - 414
Correos: Esta dirección de correo electrónico está protegida contra spambots. Necesita activar JavaScript para visualizarla.  
Telef: (01) 319-0000 Anexos: 233249

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De izquierda a derecha: Alessia Piamonte, Teresa Castromonte, Marco Acosta, Claudia Machiacado Rivero, PhD MsC.: Jesús Durand, Miluska Mori, Vilma Vise, Rodrigo Paz, Liani Bustamante, Valeria Morales, Luis  La Chira, Livisú Pajares y Juan J. Contreras