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Inicio

La Unidad de Genómica (GRU), formó parte del consorcio internacional para el secuenciamiento del genoma de la papa bajo la dirección de la Dra. Orjeda quien logró equipar la Unidad y formar investigadores en genómica de plantas abriendo una nueva línea de Investigacion en la UPCH.

Presentación

La Unidad de Genómica (GRU), se ha convertido en un centro de referencia para Genómica de plantas en el Perú. Trabajamos activamente en ensamblaje genómico, desarrollo de mapas físicos y genético integrando marcadores moleculares. Anotación genómica e identificación in silico de familias de genes. Experiencia en RNA-seq usando variedades de papas nativas. La Unidad de Genómica desarrolla proyectos con fondos nacionales e internacionales en papa, cebada, uva, quina, quinua, café y cacao.

Equipo de Investigación

MSc. PhD(c). Edgar Neyra Valdez, Jefe (Ver Ficha)
Ph.D. Daniel Clark Leza, Profesor asociado (Ver Ficha)
MSc. Olga Patricia Ponce Travezaño(Ver Ficha)
MSc(c). Diana Martinez Corcino (Ver Ficha)
MSc. Maria Julia Gonzales Llontop (Ver Ficha)
MSc. Jose Alejandro Chang Kee Anselm (Ver Ficha)
MSc. Cesar Cotera Huayhua (Ver Ficha)
MSc. Hans Carreño (Ver Ficha)
Ph.D(c) Roberto Lozano 
MSc. PhD(c) Lorena Ramirez (Ver Ficha)

Proyectos en marcha

  • Genotipificación por secuenciamiento (GBS) y su asociación con caracteres agronómicos de importancia comercial de la diversidad genética promisoria de quinua (Chenopodium quinoa Willd) del Banco de Germoplasma del INIA
    Coordinador General: Edgar Neyra Valdez
    Investigador Principal: Edgar Neyra Valdez
    Co-investigadores: Olga Ponce
    Entidad Financiadora: PNIA
    Monto: 1’529,367.50 Soles
    Duración: 2016-2018
  • Desarrollo de variedades de papa mejorada y nativa para consumo directo y procesamiento con calidad nutricional, adecuadas al cambio climático
    Investigador Principal: Máximo Morote Quispe
    Co-investigadores: Diana Martinez, Edgar Neyra
    Entidad Financiadora: PNIA
    Monto: 450,000.00 Soles
    Duración: Inicio 2016, 18 meses
  • Identificación de alelos asociados a calidad industrial de chips en cruzas de papas nativas de pulpa coloreada
    Coordinador General: Demetrio López Portilla
    Co-investigadores: Edgar Neyra, Diana Martinez
    Entidad Financiadora: FONDECYT
    Monto: 400,000.00 Soles
    Duración: Inicio 2016, 2 años
  • Estudio de la variabilidad genética de Peronospora sp. que ocasiona el mildiu en el cultivo de quinua (Chenopodium quinoa Willd) y búsqueda de accesiones diferenciales
    Coordinador General: Rigoberto Estrada Zúñiga
    Co-investigadores: Edgar Neyra, César Cotera Huayhua,
    Entidad Financiadora: PNIA
    Monto: 400,000.00 Soles
    Duración: Inicio 2016, 2 años
  • Situación fitosanitaria de las principales zonas productoras de semilla de papa en las regiones de Cusco, Apurímac, Ayacucho y Junín: Prospección y detección por DAS-ELISA, RT PCR y plantas indicadoras para 6 virus de importancia”
    Coordinador General: Ladislao Palomino Flores
    Responsable integrante de la Alianza estratégica: Edgar Neyra
    Co-Investigadores: María Julia Gonzales Llontop, Hans Carreño Fernández
    Entidad Financiadora: PNIA
    Monto: 558,035.00 Soles
    Duración: Inicio 2016, 2 años
  • Prospección del uso de plantas nativas para la fitorremediación de suelos contaminados por la actividad minera
    Coordinador General: Raul Loayza Muro
    Investigador Principal: Raúl Loayza Muro
    Co-Investigadores: Edgar Neyra Valdez;, Olga Ponce Travezaño, María Julia Gonzales Llontop, José Alejandro Chang Kee Anselmo.
    Entidad Financiadora: FINCyT.
    Monto: 397,500.00 Soles
    Duración: Inicio 2015, 18 meses

Publicaciones

  • Gutiérrez L, Germán S, Pereyra S, Hayes PM, Pérez CA, Capettini F, Locatelli A, Berberian NM, Falconi EE, Estrada R, Fros D, Gonza V, Altamirano H, Huerta-Espino J, Neyra E, Orjeda G, Sandoval-Islas S, Singh R, Turkington K, Castro AJ. Multi-environment multi-QTL association mapping identifies disease resistance QTL in barley germplasm from Latin America. Theor Appl Genet. 2015 Mar;128(3):501-16. doi: 10.1007/s00122-014-2448-y. Epub 2014 Dec 30.
  • Yerisf Torres, Roberto Lozano, Carlos Merino y Gisella Orjeda. Identificación de genes relacionados a sequía en papas nativas empleando RNA-Seq. Rev. peru. biol. 20(3): 211 - 214 (Marzo 2014)
  • Kumar S., Bolser D., de Boer J., Sønderkær M., Amoros W., Carboni M., D’Ambrosio J.,de la Cruz G., Di Genova, A.,Douches D., Eguiluz M., Guo X.,Guzman F.,Hackett C.,Hamilton J., Li G., Li Y., Lozano R., Maass A., Marshall D., Martinez D., McLean K., Mejía N., Linda Milne L., Munive S., Nagy I., Ponce O., Ramirez M., Simon R., Thomson S., Torres Y., Waugh R., Zhang Z.,Huang S., Visser R.,Bachem C., Sagredo B., Feingold S., Orjeda G., Veilleux R., Bonierbale M., Jacobs J.,Milbourne D., Martin D., Bryan G. (2013). Construction of Reference Chromosome-Scale Pseudomolecules for Potato: Integrating the Potato Genome with Genetic and Physical Maps. G3: Genes | Genomes | Genetics: Volume 3(11):2031-47. doi: 10.1534/g3.113.007153
  • Lozano R, Ponce O, Ramirez M, Mostajo N, Orjeda G (2012) Genome-Wide Identification and Mapping of NBS-Encoding Resistance Genes in Solanum tuberosum Group Phureja. PLoS ONE: 7(4): e34775. doi: 10.1371/journal.pone.0034775

       TESIS:

  • Tesis Post-grado. Maestría en Bioquímica y Biología Molecular.
    Título: “Patrones de expresión de genes asociados con la respuesta a restricción hídrica de 6 poblaciones del tomate silvestre Solanum pimpinellifolium de las regiones Lima y Piura”
    Lorena Ramirez Gonzales. 2016 - Universidad Peruana Cayetano Heredia
  • Tesis Post-grado. Maestria en Bioquímica y Biología Molecular.
    Título: “Identificación de microARNs (miRNAs) asociados al estrés hídrico en Solanum tuberosum subsp. Andigena”.
    Olga Patricia Ponce Travezaño. 2016 - Universidad Peruana Cayetano Heredia
  • Tesis Post-grado. Maestría en Bioquímica y Biología Molecular.
    Título: “Caracterización de seis poblaciones de Solanum pimpinellifolium de las regiones Piura y Lima respecto de su resistencia a Phytophthora infestans”.
    José Alejandro Chang Kee Anselmo. 2016- Universidad Peruana Cayetano Heredia
  • Tesis Post-grado. Maestría en Bioquímica y Biología Molecular.
    Título:“Estandarización de técnicas moleculares (RT-PCR e IC-RT-PCR) para el diagnóstico de infección por los principales virus que atacan a las uvas pisqueras del Perú”
    Maria Julia Gonzales Llontop. 2016 - Universidad Peruana Cayetano Heredia
  • Tesis Post-grado. Maestría en Bioquímica y Biología Molecular.
    Título: “Diversidad molecular de Puccinia striiformis f.sp. Hordei en la región norte de Ayacucho”
    Cesar Cotera Huayhua. 2016 - Universidad Peruana Cayetano Heredia
  • Tesis Post-grado. Maestría en Bioquímica y Biología Molecular.
    Título: “Análisis transcriptómico de la respuesta a heladas en papas nativas”
    Mey-Ling Espinoza. 2017 - Universidad Peruana Cayetano Heredia
  • Tesis Pre-grado. Licenciatura en Biologia.
    Título: “Caracterización genética de la biodiversidad y estructuración poblacional de los cultivos primarios de Chenopodium quinoa de la región de Ayacucho, Perú”
    Francisco Menéndez. 2016 - Universidad Peruana Cayetano Heredia

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